Antisipasi risiko terhadap penggunaan biodiesel di sektor hulu dan hilir mengemuka seiring dengan program mandatori biodiesel yang dicanangkan pemerintah.
Selain perihal emisi, produksi biodiesel juga harus tetap memperhatikan terpenuhinnya prinsip keberlanjutan agar sepenuhnya menjadi bahan bakar ramah lingkungan.